Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:
- p -
- p : PLMD::F1dim< FCLASS >, PLMD::generic::Plumed, PLMD::MDAtomsTyped< T >, plumed, plumed_function_holder
- P0_contribution_ : PLMD::opes::ECVcustom, PLMD::opes::ECVumbrellasFile, PLMD::opes::ECVumbrellasLine
- pace_ : PLMD::bias::MaxEnt
- paction : PLMD::FlexibleBin
- pair_ : PLMD::generic::WrapAround
- pairs : PLMD::ERMSD
- parallelread : PLMD::function::FilesHandler, PLMD::function::FuncSumHills
- parameter : PLMD::colvar::EEFSolv
- parameters : PLMD::function::Combine, PLMD::function::Stats, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase, PLMD::vesselbase::VesselOptions
- params_ : PLMD::maze::Loss
- parent_to_child : PLMD::Subprocess
- pars_da : PLMD::isdb::CS2BackboneDB
- partialTaskList : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
- partition_estimate_ : PLMD::fisst::FISST
- partner : PLMD::GREX
- passMap : PLMD::PlumedMain
- past_increment2_ : PLMD::ves::VesDeltaF
- path : PLMD::FileBase
- path_cv_values : PLMD::function::FuncPathGeneral
- pathfile : PLMD::mapping::AdaptivePath
- PatternFlag : PLMD::ExchangePatterns
- pbc : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::Atoms, PLMD::colvar::Angle, PLMD::colvar::ContactMap, PLMD::colvar::CoordinationBase, PLMD::colvar::Distance, PLMD::colvar::EEFSolv, PLMD::colvar::ERMSD, PLMD::colvar::Position, PLMD::colvar::ProjectionOnAxis, PLMD::colvar::Template, PLMD::colvar::Torsion, PLMD::funnel::FUNNEL_PS, PLMD::gridtools::GridVessel, PLMD::isdb::CS2Backbone, PLMD::isdb::FretEfficiency, PLMD::isdb::JCoupling, PLMD::isdb::NOE, PLMD::isdb::PRE, PLMD::isdb::RDC, PLMD::isdb::SAXS, PLMD::mapping::PathReparameterization, PLMD::pamm::PammObject, PLMD::piv::PIV
- pbc_ : PLMD::colvar::DRMSD, PLMD::GridBase, PLMD::isdb::EMMI, PLMD::maze::Optimizer, PLMD::NeighborList, PLMD::s2cm::S2ContactModel
- pbc_fwd : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::Atoms
- pbc_param : PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
- pbox : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- pca : PLMD::ReferenceValuePack
- pca_names : PLMD::colvar::PCARMSD
- pdb : PLMD::funnel::FUNNEL_PS, PLMD::GenericMolInfo
- pdb_fwd : PLMD::GenericMolInfo
- pdbv : PLMD::colvar::PathMSDBase, PLMD::colvar::PCARMSD
- pDdStep : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- pdisplacements : PLMD::mapping::AdaptivePath
- period_ : PLMD::fisst::FISST
- periodic_ : PLMD::ves::BasisFunctions, PLMD::ves::TD_Grid
- periodicity : PLMD::HistogramBead, PLMD::Value
- periods_ : PLMD::ves::TD_VonMises
- perp : PLMD::multicolvar::VolumeCavity, PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
- perp_dirs : PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
- pf_n_ : PLMD::bias::PBMetaD
- pfbox : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- pfhold_ : PLMD::bias::PBMetaD
- pForces : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- pfs_ : PLMD::bias::PBMetaD
- pGatindex : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- phases : PLMD::vatom::Center
- phivs : PLMD::logmfd::LogMFD
- physical_time : PLMD::molfile::molfile_timestep_t
- pid : PLMD::Subprocess
- pilots : PLMD::PlumedMain
- plumed : PLMD::Action, PLMD::ActionOptions, PLMD::ActionSet, PLMD::Atoms, PLMD::DataFetchingObject, PLMD::FileBase
- plumedDat : PLMD::PlumedMain
- plumedMain : PLMD::GREX
- pNLocalAtoms : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- pntrToECVsClass_ : PLMD::opes::OPESexpanded
- pointer : PLMD::Communicator::ConstData, PLMD::Communicator::Data
- points : PLMD::function::Piecewise, PLMD::funnel::FUNNEL_PS
- pos : PLMD::molfile::md_atom, PLMD::molfile::md_ts, PLMD::multicolvar::VolumeInEnvelope
- pos1 : PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
- pos2 : PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
- position : PLMD::isdb::CS2Backbone::RingInfo
- positions : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::analysis::DataCollectionObject, PLMD::Atoms, PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift, PLMD::generic::Plumed, PLMD::PDB, PLMD::RMSDCoreData
- positions_center : PLMD::RMSD
- positions_center_is_calculated : PLMD::RMSD
- positions_center_is_removed : PLMD::RMSD
- positionsHaveBeenSet : PLMD::Atoms
- positionsToBeReceived : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- positionsToBeSent : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- potential_expansion_pntr : PLMD::ves::MD_LinearExpansionPES
- power : PLMD::function::Ensemble
- powers : PLMD::function::Combine, PLMD::vesselbase::Moments
- POXYGENS : PLMD::membranefusion::fusionPoreExpansionP, PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP
- pPositions : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- pre_fact_ : PLMD::isdb::EMMI
- prec : PLMD::molfile::md_file
- prefactor_a_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
- preps : PLMD::analysis::OutputColvarFile, PLMD::gridtools::GridPrintingBase
- pres0_ : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
- pres_ : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
- pres_low_ : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
- pres_size : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
- press_ : PLMD::bias::ReweightTemperaturePressure, PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
- pretty : PLMD::Exception::Location
- prev_exp_alpha_ : PLMD::ves::VesDeltaF
- prev_pos : PLMD::piv::PIV::SharedData
- prev_stp : PLMD::piv::PIV::SharedData
- previous_fields : PLMD::OFile
- print_charges : PLMD::generic::DumpMassCharge
- print_debug_info_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- print_masses : PLMD::generic::DumpMassCharge
- print_stride_ : PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::ves::VesDeltaF
- printFirstStep : PLMD::bias::MaxEnt
- printStride : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- prior_ : PLMD::isdb::EMMI
- prob_ : PLMD::ves::VesDeltaF
- probability_decreaser_ : PLMD::maze::Simulated_Annealing
- proj : PLMD::function::FuncSumHills
- projdir : PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
- projection_args_ : PLMD::ves::VesBias
- projections : PLMD::dimred::DimensionalityReductionBase
- property : PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath, PLMD::dimred::SketchMapRead, PLMD::mapping::Mapping
- pseudo_virial_ : PLMD::eds::EDS
- pseudo_virial_sum_ : PLMD::eds::EDS
- pt : PLMD::F1dim< FCLASS >
- ptr : PLMD::lepton::AsmJitRuntimePtr, PLMD::PlumedMain::plumed_error_handler, PLMD::TypesafePtr, plumed_nothrow_handler, plumed_nothrow_handler_x, plumed_safeptr, plumed_safeptr_x
- pulling_ : PLMD::maze::Steered_MD
- pval : PLMD::multicolvar::DistanceFromContour
- pweights : PLMD::dimred::SketchMapBase
- px : PLMD::MDAtomsTyped< T >
- py : PLMD::MDAtomsTyped< T >
- pythonCmd : PLMD::GenericMolInfo
- pz : PLMD::MDAtomsTyped< T >