Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:
- i -
- i : PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row, PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
- IA : PLMD::Random
- iclose1 : PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
- iclose2 : PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
- identical_coeffs_shape_ : PLMD::ves::Optimizer
- idum : PLMD::Random
- ifile : PLMD::bias::MaxEnt, PLMD::generic::Read
- ifile_ptr : PLMD::generic::Read
- ifiles : PLMD::function::FilesHandler
- ifiles_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
- ifilesnames : PLMD::bias::MaxEnt
- ifilesnames_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
- ignore_forces : PLMD::generic::Read
- ignore_time : PLMD::generic::Read
- ignoreFields : PLMD::IFile
- igolden : PLMD::gridtools::GridVessel
- IM : PLMD::Random
- imag_modes : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
- imgVec : PLMD::colvar::PathMSDBase
- in : PLMD::CLToolMain
- in_apply : PLMD::analysis::Histogram
- in_restart_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
- in_restart_name_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
- incPrec : PLMD::Random
- index : PLMD::ActionWithVirtualAtom, PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath, PLMD::generic::Plumed, PLMD::vatom::ActionWithVirtualAtom
- index_ : PLMD::AtomNumber
- index_k_ : PLMD::opes::OPESexpanded
- indexCnt : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexDsp : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexes : PLMD::ActionAtomistic
- indexmap : PLMD::function::FuncPathMSD
- indexOfTaskInFullList : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
- indexR : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexS : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- indexToBeReceived : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- indexToBeSent : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- indexvec : PLMD::colvar::PathMSDBase
- indices : PLMD::analysis::DataCollectionObject, PLMD::multicolvar::AtomValuePack, PLMD::multicolvar::CatomPack, PLMD::MultiValue, PLMD::ReferenceAtoms
- indices_shape_ : PLMD::ves::CoeffsBase
- inept : PLMD::isdb::PRE
- info : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
- ingrid : PLMD::gridtools::ActionWithInputGrid, PLMD::gridtools::GridPrintingBase
- init : PLMD::HistogramBead, PLMD::SwitchingFunction, PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
- init_stp : PLMD::piv::PIV::SharedData
- initial_weight_dist_ : PLMD::fisst::FISST
- initial_weight_rate_ : PLMD::fisst::FISST
- initialBias : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- initialized : PLMD::GREX, PLMD::PlumedMain
- initstride : PLMD::function::FuncSumHills
- inMiddleOfField : PLMD::IFile
- input_count : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- input_filename : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- input_grad : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- input_of_each_layer : PLMD::function::annfunc::ANN
- inputData : PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool
- inputdata : PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool
- inputForce : PLMD::Value
- insertion : PLMD::molfile::molfile_atom_t
- inst_alpha_ : PLMD::ves::VesDeltaF
- integratehills : PLMD::function::FuncSumHills
- integratehisto : PLMD::function::FuncSumHills
- intensities : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
- intercomm : PLMD::cltools::GenExample, PLMD::generic::Plumed, PLMD::GREX
- intercomm_fwd : PLMD::GREX
- interval : PLMD::logmfd::LogMFD
- interval_bounded_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_max_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_max_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_mean_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_min_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_min_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_intrinsic_range_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_max_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_max_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_mean_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_min_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_min_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- interval_range_ : PLMD::ves::BasisFunctions
- inthessian : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
- intracomm : PLMD::cltools::GenExample, PLMD::GREX
- intracomm_fwd : PLMD::GREX
- intValue : PLMD::lepton::Operation::PowerConstant
- inum : PLMD::vesselbase::BridgeVessel
- inv_cov_md_ : PLMD::isdb::EMMI
- inv_gamma_ : PLMD::ves::VesDeltaF
- inv_max_minus_min : PLMD::HistogramBead, PLMD::Value
- inv_normfactor_ : PLMD::ves::BF_CubicBsplines, PLMD::ves::BF_Powers
- inv_r_eff_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
- inv_sigma_ : PLMD::ves::BF_Gaussians
- inv_spacing_ : PLMD::ves::BF_CubicBsplines
- inv_sqrt2_ : PLMD::isdb::EMMI
- invalidateList : PLMD::colvar::CoordinationBase, PLMD::s2cm::S2ContactModel
- invbeta : PLMD::BiasWeight, PLMD::ProbWeight, PLMD::ves::FesWeight
- invbiasf_ : PLMD::ves::WellTemperedModifer
- invBox : PLMD::Pbc
- inverse : PLMD::adjmat::ClusterDistribution
- invlambda : PLMD::mapping::ZpathVessel
- invr0 : PLMD::SwitchingFunction
- invr0_ : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
- invr0_2 : PLMD::SwitchingFunction
- invReduced : PLMD::Pbc
- invsigma : PLMD::bias::MetaD::Gaussian, PLMD::bias::PBMetaD::Gaussian
- iov_base : PLMD::molfile::fio_iovec
- iov_len : PLMD::molfile::fio_iovec
- ipos : PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift
- iprecision : PLMD::generic::DumpAtoms
- IQ : PLMD::Random
- Iq0 : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_mix : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_mix_D : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_mix_H : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_solv : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_solv_H : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_vac : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_vac_D : PLMD::isdb::SAXS
- Iq0_vac_H : PLMD::isdb::SAXS
- IR : PLMD::Random
- ir_size : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
- is_active : PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
- is_file : PLMD::TypesafePtr
- is_floating_point : PLMD::TypesafePtr
- is_integral : PLMD::TypesafePtr
- isaction : PLMD::Keywords
- isatoms : PLMD::Keywords
- isChargeSet_ : PLMD::vatom::Center
- iscltool : PLMD::function::FuncSumHills
- isdens : PLMD::crystallization::GradientVessel
- isDerivative : PLMD::lepton::Operation::Custom
- iselect : PLMD::isdb::MetainferenceBase
- isEnergy : PLMD::colvar::Colvar, PLMD::Colvar, PLMD::sasa::Colvar
- isExtraCV : PLMD::colvar::Colvar, PLMD::Colvar, PLMD::sasa::Colvar
- isFirstStep : PLMD::bias::MaxEnt, PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift, PLMD::isdb::SAXS, PLMD::ves::Optimizer
- isFirstStep_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD, PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >, PLMD::ves::VesDeltaF
- isInitialized : PLMD::RMSDCoreData
- isIntPower : PLMD::lepton::Operation::PowerConstant
- isMassSet_ : PLMD::vatom::Center
- isopen : PLMD::function::FilesHandler
- isReady_ : PLMD::opes::ExpansionCVs
- iswhole_ : PLMD::GenericMolInfo
- items : PLMD::Citations
- iter_counter : PLMD::ves::Optimizer
- iter_tol : PLMD::dimred::SketchMapSmacof
- iteration_and_time_active_ : PLMD::ves::CoeffsBase
- iteration_opt : PLMD::ves::CoeffsBase
- ITMAX : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >, PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
- iv : PLMD::Random
- iy : PLMD::Random