Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- v -
- v_size : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
- VAL : PLMD::isdb::CS2Backbone, PLMD::isdb::SAXS
- val_at_cutoff_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
- VAL_BB : PLMD::isdb::SAXS
- VAL_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
- validate_list_ : PLMD::maze::Optimizer
- Value() : PLMD::Value
- value : PLMD::FileBase::FieldBase, PLMD::lepton::Operation::AddConstant, PLMD::lepton::Operation::Constant, PLMD::lepton::Operation::MultiplyConstant, PLMD::lepton::Operation::PowerConstant, PLMD::Value
- value_action_ : PLMD::maze::Optimizer
- value_bias_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- value_descriptor() : PLMD::crystallization::GradientVessel, PLMD::crystallization::VectorMean, PLMD::crystallization::VectorSum, PLMD::mapping::SpathVessel, PLMD::mapping::ZpathVessel, PLMD::vesselbase::AltMin, PLMD::vesselbase::Between, PLMD::vesselbase::Highest, PLMD::vesselbase::LessThan, PLMD::vesselbase::Lowest, PLMD::vesselbase::Max, PLMD::vesselbase::Mean, PLMD::vesselbase::Min, PLMD::vesselbase::MoreThan, PLMD::vesselbase::Sum, PLMD::vesselbase::ValueVessel
- value_dir_x_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- value_dir_y_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- value_dir_z_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- value_dist_ : PLMD::maze::Random_Acceleration_MD
- value_force2_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
- value_force_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- value_out : PLMD::vesselbase::Moments
- value_pressure_ : PLMD::eds::EDS
- value_sampling_radius_ : PLMD::maze::Optimizer
- value_set : PLMD::Value
- value_total_dist_ : PLMD::maze::Random_Acceleration_MD, PLMD::maze::Steered_MD
- value_total_distance_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- value_x_ : PLMD::maze::Optimizer
- value_y_ : PLMD::maze::Optimizer
- value_z_ : PLMD::maze::Optimizer
- valueAccept : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueAcceptFT : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueAcceptScale : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueBias : PLMD::bias::Bias
- valueForce2 : PLMD::bias::MaxEnt, PLMD::bias::Restraint
- valueForce2_ : PLMD::ves::VesLinearExpansion
- valueFtilde : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueHasBeenSet() : PLMD::Value
- valueOffset : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- values : PLMD::ActionWithValue, PLMD::BiasRepresentation, PLMD::colvar::Constant, PLMD::function::Custom, PLMD::MultiValue
- valueScale : PLMD::isdb::Caliber, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueScore : PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueSigma : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- valueSigmaMean : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- ValueVessel() : PLMD::vesselbase::ValueVessel
- valueWork : PLMD::bias::MaxEnt
- var : PLMD::function::Custom, PLMD::isdb::Caliber
- var_coeffs_pntrs_ : PLMD::ves::Opt_Adam
- VarCoeffs() : PLMD::ves::Opt_Adam
- VARIABLE : PLMD::lepton::Operation
- Variable() : PLMD::lepton::Operation::Variable, PLMD::lepton::ParseToken
- variable_str_ : PLMD::ves::BF_Custom
- variableIndices : PLMD::lepton::CompiledExpression
- variableNames : PLMD::lepton::CompiledExpression
- variablePointers : PLMD::lepton::CompiledExpression
- variablesToCopy : PLMD::lepton::CompiledExpression
- variance : PLMD::FlexibleBin
- varmax_coeffs_pntrs_ : PLMD::ves::Opt_Adam
- VarmaxCoeffs() : PLMD::ves::Opt_Adam
- VcrossTensor : PLMD::TensorGeneric< n, m >
- vec_loss_ : PLMD::maze::Optimizer
- vecsize : PLMD::vesselbase::StoreDataVessel
- vector : PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T >
- Vector2vector() : PLMD::maze::tls
- vector2Vector() : PLMD::maze::tls
- vector_l() : PLMD::maze::tls
- vector_n() : PLMD::maze::tls
- VectorGeneric() : PLMD::VectorGeneric< n >
- VectorMean() : PLMD::crystallization::VectorMean
- VectorMultiColvar() : PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
- VectorSum() : PLMD::crystallization::VectorSum
- velocities : PLMD::molfile::molfile_timestep_t
- vend : PLMD::crystallization::Gradient
- verbose_output : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
- verse : PLMD::bias::MovingRestraint
- version : PLMD::cltools::GenExample, PLMD::cltools::GenJson, PLMD::molfile::trx_hdr, plumed_symbol_table_type_x
- version_string : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
- VesBias() : PLMD::ves::VesBias
- vesbias_pntr_ : PLMD::ves::BasisFunctions, PLMD::ves::CoeffsBase, PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion, PLMD::ves::TargetDistribution
- VesDeltaF() : PLMD::ves::VesDeltaF
- VesLinearExpansion() : PLMD::ves::VesLinearExpansion
- Vessel : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel, PLMD::vesselbase::Vessel, PLMD::vesselbase::VesselOptions
- vessel : PLMD::Keywords::KeyType
- VesselOptions() : PLMD::vesselbase::VesselOptions
- veta : PLMD::logmfd::LogMFD
- vfict : PLMD::bias::ExtendedLagrangian, PLMD::logmfd::LogMFD
- vfict_laststep : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
- vfictValue : PLMD::bias::ExtendedLagrangian, PLMD::logmfd::LogMFD
- vir_size : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
- virial : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::Atoms, PLMD::generic::Plumed, PLMD::MDAtomsTyped< T >
- virial_ : PLMD::isdb::EMMI
- virial_scaling_ : PLMD::eds::EDS
- virialHasBeenSet : PLMD::Atoms
- virialWasSet() : PLMD::ReferenceValuePack
- virtualAtomsActions : PLMD::Atoms
- visited : PLMD::adjmat::OutputCluster
- VO : PLMD::membranefusion::fusionPoreExpansionP
- Vol0 : PLMD::piv::PIV
- Volume() : PLMD::colvar::Volume
- volume : PLMD::gridtools::ActionWithIntegral
- VolumeAround() : PLMD::multicolvar::VolumeAround
- VolumeCavity() : PLMD::multicolvar::VolumeCavity
- VolumeGradientBase : PLMD::crystallization::VectorMultiColvar, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase, PLMD::multicolvar::VolumeGradientBase
- VolumeInCylinder() : PLMD::multicolvar::VolumeInCylinder
- VolumeInEnvelope() : PLMD::multicolvar::VolumeInEnvelope
- VolumeInSphere() : PLMD::multicolvar::VolumeInSphere
- VolumeTetrapore() : PLMD::multicolvar::VolumeTetrapore
- von_misses_concentration : PLMD::gridtools::HistogramOnGrid
- von_misses_norm : PLMD::gridtools::HistogramOnGrid
- vonmises : PLMD::KernelFunctions
- VonMisesDiagonal() : PLMD::ves::TD_VonMises
- voronoiAnalysis() : PLMD::analysis::LandmarkSelectionBase
- vv1 : PLMD::crystallization::VectorMultiColvar
- vv2 : PLMD::crystallization::VectorMultiColvar