Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

- t -

• Tan() : PLMD::lepton::Operation::Tan
• Tanh() : PLMD::lepton::Operation::Tanh
• Target() : PLMD::function::Target
• TargetDist() : PLMD::TargetDist
• TargetDistAverages() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion, PLMD::ves::Optimizer, PLMD::ves::VesBias
• targetDistGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• TargetDistribution() : PLMD::ves::TargetDistribution
• taskIsCurrentlyActive() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• TD_Chi() : PLMD::ves::TD_Chi
• TD_ChiSquared() : PLMD::ves::TD_ChiSquared
• TD_Custom() : PLMD::ves::TD_Custom
• TD_Exponential() : PLMD::ves::TD_Exponential
• TD_ExponentiallyModifiedGaussian() : PLMD::ves::TD_ExponentiallyModifiedGaussian
• TD_Gaussian() : PLMD::ves::TD_Gaussian
• TD_GeneralizedExtremeValue() : PLMD::ves::TD_GeneralizedExtremeValue
• TD_GeneralizedNormal() : PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal
• TD_Grid() : PLMD::ves::TD_Grid
• TD_LinearCombination() : PLMD::ves::TD_LinearCombination
• TD_Multicanonical() : PLMD::ves::TD_Multicanonical
• TD_MultithermalMultibaric() : PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
• TD_ProductCombination() : PLMD::ves::TD_ProductCombination
• TD_ProductDistribution() : PLMD::ves::TD_ProductDistribution
• TD_Uniform() : PLMD::ves::TD_Uniform
• TD_VonMises() : PLMD::ves::TD_VonMises
• TD_WellTempered() : PLMD::ves::TD_WellTempered
• temperHeight() : PLMD::bias::MetaD
• TemperingSpecs() : PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
• Template() : PLMD::colvar::Template
• TensorGeneric() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• Tetrahedral() : PLMD::crystallization::Tetrahedral
• thermostat() : PLMD::cltools::SimpleMD
• threadSafe() : PLMD::analysis::Histogram, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase, PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• Time() : PLMD::generic::Time
• tokenize() : PLMD::lepton::Parser
• TopologyMatrix() : PLMD::adjmat::TopologyMatrix
• Torsion() : PLMD::colvar::Torsion
• Torsions() : PLMD::multicolvar::Torsions
• toString() : PLMD::Keywords::KeyType, PLMD::Random
• totalNumberOfCoeffs() : PLMD::ves::VesBias
• trace() : PLMD::Exception
• trace_n() : PLMD::Exception
• transferDataToPDB() : PLMD::analysis::DataCollectionObject
• transformBridgedDerivatives() : PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase, PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction, PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• transformDerivatives() : PLMD::vesselbase::BridgeVessel, PLMD::vesselbase::Vessel
• transformHD() : PLMD::mapping::AdaptivePath, PLMD::mapping::Mapping, PLMD::mapping::PathBase
• transformHighDimensionalDistance() : PLMD::dimred::SketchMapBase
• transformLowDimensionalDistance() : PLMD::dimred::SketchMapBase
• transformName() : PLMD::vesselbase::Vessel
• translateArgument() : PLMD::ves::BasisFunctions
• transpose() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• Tree() : PLMD::Tree
• TrigonometricPathVessel() : PLMD::mapping::TrigonometricPathVessel
• trim() : PLMD::lepton::Parser, PLMD::Tools
• trimComments() : PLMD::Tools
• turnOffCoeffsOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• turnOffExponentiallyDecayingAveraging() : PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• turnOffHessian() : PLMD::ves::Optimizer
• turnOffIterationCounter() : PLMD::ves::CoeffsBase
• turnOnDerivatives() : PLMD::ActionWithValue, PLMD::adjmat::ClusterAnalysisBase, PLMD::adjmat::ClusterDiameter, PLMD::adjmat::ClusteringBase, PLMD::adjmat::ClusterSize, PLMD::analysis::Histogram, PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST, PLMD::generic::Read, PLMD::gridtools::ActionWithGrid, PLMD::gridtools::ActionWithIntegral, PLMD::isdb::EMMI, PLMD::isdb::MetainferenceBase, PLMD::mapping::Mapping, PLMD::multicolvar::BridgedMultiColvarFunction, PLMD::multicolvar::MultiColvarBase, PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• turnOnHessian() : PLMD::ves::Optimizer
• turnOnIterationCounter() : PLMD::ves::CoeffsBase
• type_str() : PLMD::TypesafePtr
• TypesafePtr() : PLMD::TypesafePtr
• typeToString() : PLMD::ves::WaveletGrid