Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:
- e -
- ECVcustom() : PLMD::opes::ECVcustom
- ECVlinear() : PLMD::opes::ECVlinear
- ECVmultiThermal() : PLMD::opes::ECVmultiThermal
- ECVmultiThermalBaric() : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
- ECVumbrellasFile() : PLMD::opes::ECVumbrellasFile
- ECVumbrellasLine() : PLMD::opes::ECVumbrellasLine
- EDS() : PLMD::eds::EDS
- EEFSolv() : PLMD::colvar::EEFSolv
- EffectiveEnergyDrift() : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- EMMI() : PLMD::isdb::EMMI
- empty() : PLMD::Citations
- emptyActiveMembers() : PLMD::DynamicList< T >, PLMD::MultiValue
- enable() : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
- enableBiasFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
- enabled() : PLMD::LinkCells
- enableDynamicTargetDistFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
- enableDynamicTargetDistribution() : PLMD::ves::VesBias
- enableFesFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
- enableFesProjFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
- enableHessian() : PLMD::ves::Optimizer, PLMD::ves::VesBias
- enableIterationNumberInFilenames() : PLMD::ves::VesBias
- enableMultipleCoeffsSets() : PLMD::ves::VesBias
- enableNestedExceptions() : PLMD::PlumedMain
- enableStaticTargetDistFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
- EndPlumed() : PLMD::generic::EndPlumed
- Energy() : PLMD::colvar::Energy
- enforceBackup() : PLMD::OFile
- enforceRestart() : PLMD::OFile
- enforceSuffix() : PLMD::FileBase
- Ensemble() : PLMD::function::Ensemble
- EnvironmentSimilarity() : PLMD::crystallization::EnvironmentSimilarity
- eraseFile() : PLMD::PlumedMain
- Erf() : PLMD::lepton::Operation::Erf
- Erfc() : PLMD::lepton::Operation::Erfc
- ERMSD() : PLMD::colvar::ERMSD, PLMD::ERMSD
- error() : PLMD::Action, PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool, PLMD::DLLoader, PLMD::ReferenceConfiguration, PLMD::vesselbase::Vessel
- estimateNumSteps() : PLMD::opes::ExpansionCVs
- EuclideanDissimilarityMatrix() : PLMD::analysis::EuclideanDissimilarityMatrix
- EuclideanDistance() : PLMD::EuclideanDistance
- evaluate() : PLMD::KernelFunctions, PLMD::lepton::CompiledExpression, PLMD::lepton::CustomFunction, PLMD::lepton::ExpressionProgram, PLMD::lepton::Operation::Abs, PLMD::lepton::Operation::Acos, PLMD::lepton::Operation::Add, PLMD::lepton::Operation::AddConstant, PLMD::lepton::Operation::Asin, PLMD::lepton::Operation::Atan2, PLMD::lepton::Operation::Atan, PLMD::lepton::Operation::Ceil, PLMD::lepton::Operation::Constant, PLMD::lepton::Operation::Cos, PLMD::lepton::Operation::Cosh, PLMD::lepton::Operation::Cot, PLMD::lepton::Operation::Csc, PLMD::lepton::Operation::Cube, PLMD::lepton::Operation::Custom, PLMD::lepton::Operation::Delta, PLMD::lepton::Operation::Divide, PLMD::lepton::Operation::Erf, PLMD::lepton::Operation::Erfc, PLMD::lepton::Operation, PLMD::lepton::Operation::Exp, PLMD::lepton::Operation::Floor, PLMD::lepton::Operation::Log, PLMD::lepton::Operation::Max, PLMD::lepton::Operation::Min, PLMD::lepton::Operation::Multiply, PLMD::lepton::Operation::MultiplyConstant, PLMD::lepton::Operation::Nandelta, PLMD::lepton::Operation::Negate, PLMD::lepton::Operation::Power, PLMD::lepton::Operation::PowerConstant, PLMD::lepton::Operation::Reciprocal, PLMD::lepton::Operation::Sec, PLMD::lepton::Operation::Select, PLMD::lepton::Operation::Sin, PLMD::lepton::Operation::Sinh, PLMD::lepton::Operation::Sqrt, PLMD::lepton::Operation::Square, PLMD::lepton::Operation::Step, PLMD::lepton::Operation::Subtract, PLMD::lepton::Operation::Tan, PLMD::lepton::Operation::Tanh, PLMD::lepton::Operation::Variable, PLMD::lepton::ParsedExpression, PLMD::lepton::PlaceholderFunction, PLMD::pamm::HBPammObject, PLMD::pamm::PammObject
- evaluateDerivative() : PLMD::lepton::CustomFunction, PLMD::lepton::PlaceholderFunction
- evaluateGaussian() : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
- evaluateGaussianAndDerivatives() : PLMD::bias::MetaD
- evaluateKernel() : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
- evaluateNumericalDerivatives() : PLMD::cltools::Driver< real >
- Exception() : PLMD::Exception, PLMD::ExceptionDebug, PLMD::ExceptionError, PLMD::ExceptionTypeError, PLMD::lepton::Exception
- ExchangePatterns() : PLMD::ExchangePatterns
- exists() : PLMD::ActionWithValue, PLMD::Keywords
- exit() : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
- Exp() : PLMD::lepton::Operation::Exp
- expandArgKeywordInPDB() : PLMD::ActionWithArguments
- ExpansionCVs() : PLMD::opes::ExpansionCVs
- explore() : PLMD::adjmat::DFSClustering, PLMD::adjmat::OutputCluster
- explore_dfs() : PLMD::adjmat::OutputCluster
- ExponentiallyModifiedGaussianDiagonal() : PLMD::ves::TD_ExponentiallyModifiedGaussian
- ExponentialPowerDiagonal() : PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal
- ExpressionProgram() : PLMD::lepton::ExpressionProgram
- ExpressionTreeNode() : PLMD::lepton::ExpressionTreeNode
- ExtendedLagrangian() : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
- extension() : PLMD::Tools
- External() : PLMD::bias::External
- extra_msg() : PLMD::TypesafePtr
- extractArgumentDisplacement() : PLMD::Direction, PLMD::ReferenceArguments
- extractAtomicDisplacement() : PLMD::Direction, PLMD::MultiDomainRMSD, PLMD::OptimalRMSD, PLMD::ReferenceAtoms, PLMD::SimpleRMSD
- extractDisplacementVector() : PLMD::ReferenceConfiguration
- ExtraCV() : PLMD::colvar::ExtraCV