Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- e -

• e_size : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
• ECVcustom() : PLMD::opes::ECVcustom
• ECVlinear() : PLMD::opes::ECVlinear
• ECVmultiThermal() : PLMD::opes::ECVmultiThermal
• ECVmultiThermalBaric() : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
• ECVs_ : PLMD::opes::ECVcustom, PLMD::opes::ECVlinear, PLMD::opes::ECVmultiThermal, PLMD::opes::ECVumbrellasFile, PLMD::opes::ECVumbrellasLine, PLMD::opes::OPESexpanded
• ECVs_beta_ : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
• ECVs_pres_ : PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric
• ECVumbrellasFile() : PLMD::opes::ECVumbrellasFile
• ECVumbrellasLine() : PLMD::opes::ECVumbrellasLine
• EDS() : PLMD::eds::EDS
• eed : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• EEFSolv() : PLMD::colvar::EEFSolv
• EffectiveEnergyDrift() : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• eigenvals : PLMD::RMSDCoreData
• eigenvecs : PLMD::adjmat::Sprint, PLMD::RMSDCoreData
• eigenvectors : PLMD::colvar::PCARMSD
• eigvals : PLMD::adjmat::Sprint
• EMMI() : PLMD::isdb::EMMI
• empty() : PLMD::Citations
• emptyActiveMembers() : PLMD::DynamicList< T >, PLMD::MultiValue
• emptyKeys : PLMD::ActionOptions, PLMD::CLToolOptions, PLMD::vesselbase::VesselOptions
• enable() : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• enableBiasFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enabled() : PLMD::LinkCells
• enableDynamicTargetDistFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enableDynamicTargetDistribution() : PLMD::ves::VesBias
• enableFesFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enableFesProjFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• enableHessian() : PLMD::ves::Optimizer, PLMD::ves::VesBias
• enableIterationNumberInFilenames() : PLMD::ves::VesBias
• enableMultipleCoeffsSets() : PLMD::ves::VesBias
• enableNestedExceptions() : PLMD::PlumedMain
• enablePythonInterpreter : PLMD::GenericMolInfo
• enableStaticTargetDistFileOutput() : PLMD::ves::VesBias
• end : PLMD::generic::UpdateIf
• EndPlumed() : PLMD::generic::EndPlumed
• endPlumed : PLMD::PlumedMain
• ene_ : PLMD::isdb::EMMI
• Energy() : PLMD::colvar::Energy
• energy : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::Atoms, PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t, PLMD::Units
• energyHasBeenSet : PLMD::Atoms
• energyString : PLMD::Units
• enforceBackup() : PLMD::OFile
• enforceBackup_ : PLMD::OFile
• enforcedSuffix : PLMD::FileBase
• enforcedSuffix_ : PLMD::FileBase
• enforceRestart() : PLMD::OFile
• enforceRestart_ : PLMD::OFile
• enforceSuffix() : PLMD::FileBase
• eng_pointer : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• engf_pointer : PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >, PLMD::F1dim< FCLASS >, PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >, PLMD::MinimiseBase< FCLASS >, PLMD::RootFindingBase< FCLASS >
• engfnc_pointer : PLMD::F1dim< FCLASS >, PLMD::RootFindingBase< FCLASS >
• ens_dim : PLMD::function::Ensemble, PLMD::function::LocalEnsemble
• Ensemble() : PLMD::function::Ensemble
• ensemble : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• environments_ : PLMD::crystallization::EnvironmentSimilarity
• environmentsAtomNames_ : PLMD::crystallization::EnvironmentSimilarity
• EnvironmentSimilarity() : PLMD::crystallization::EnvironmentSimilarity
• eof : PLMD::FileBase
• EPS : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >, PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >, PLMD::Random
• eps : PLMD::bias::LWalls, PLMD::bias::UWalls, PLMD::manyrestraints::LWalls, PLMD::manyrestraints::UWalls
• epsilon : PLMD::colvar::DHEnergy
• epsilon_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >, PLMD::ves::Opt_Adam, PLMD::ves::TD_Multicanonical, PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
• epsilonClose : PLMD::colvar::PathMSDBase
• eraseFile() : PLMD::PlumedMain
• ERF : PLMD::lepton::Operation
• Erf() : PLMD::lepton::Operation::Erf
• ERFC : PLMD::lepton::Operation
• Erfc() : PLMD::lepton::Operation::Erfc
• ERMSD() : PLMD::colvar::ERMSD, PLMD::ERMSD
• ermsd : PLMD::colvar::ERMSD
• err : PLMD::FileBase
• error() : PLMD::Action, PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool, PLMD::DLLoader, PLMD::ReferenceConfiguration, PLMD::vesselbase::Vessel
• error_code : plumed_error
• error_handler : PLMD::PlumedMain
• error_type : PLMD::bias::MaxEnt
• estimateNumSteps() : PLMD::opes::ExpansionCVs
• etas : PLMD::colvar::GHBFIX
• EuclideanDissimilarityMatrix() : PLMD::analysis::EuclideanDissimilarityMatrix
• EuclideanDistance() : PLMD::EuclideanDistance
• evaluate() : PLMD::KernelFunctions, PLMD::lepton::CompiledExpression, PLMD::lepton::CustomFunction, PLMD::lepton::ExpressionProgram, PLMD::lepton::Operation::Abs, PLMD::lepton::Operation::Acos, PLMD::lepton::Operation::Add, PLMD::lepton::Operation::AddConstant, PLMD::lepton::Operation::Asin, PLMD::lepton::Operation::Atan2, PLMD::lepton::Operation::Atan, PLMD::lepton::Operation::Ceil, PLMD::lepton::Operation::Constant, PLMD::lepton::Operation::Cos, PLMD::lepton::Operation::Cosh, PLMD::lepton::Operation::Cot, PLMD::lepton::Operation::Csc, PLMD::lepton::Operation::Cube, PLMD::lepton::Operation::Custom, PLMD::lepton::Operation::Delta, PLMD::lepton::Operation::Divide, PLMD::lepton::Operation::Erf, PLMD::lepton::Operation::Erfc, PLMD::lepton::Operation, PLMD::lepton::Operation::Exp, PLMD::lepton::Operation::Floor, PLMD::lepton::Operation::Log, PLMD::lepton::Operation::Max, PLMD::lepton::Operation::Min, PLMD::lepton::Operation::Multiply, PLMD::lepton::Operation::MultiplyConstant, PLMD::lepton::Operation::Nandelta, PLMD::lepton::Operation::Negate, PLMD::lepton::Operation::Power, PLMD::lepton::Operation::PowerConstant, PLMD::lepton::Operation::Reciprocal, PLMD::lepton::Operation::Sec, PLMD::lepton::Operation::Select, PLMD::lepton::Operation::Sin, PLMD::lepton::Operation::Sinh, PLMD::lepton::Operation::Sqrt, PLMD::lepton::Operation::Square, PLMD::lepton::Operation::Step, PLMD::lepton::Operation::Subtract, PLMD::lepton::Operation::Tan, PLMD::lepton::Operation::Tanh, PLMD::lepton::Operation::Variable, PLMD::lepton::ParsedExpression, PLMD::lepton::PlaceholderFunction, PLMD::pamm::HBPammObject, PLMD::pamm::PammObject
• evaluateDerivative() : PLMD::lepton::CustomFunction, PLMD::lepton::PlaceholderFunction
• evaluateGaussian() : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• evaluateGaussianAndDerivatives() : PLMD::bias::MetaD
• evaluateKernel() : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• evaluateNumericalDerivatives() : PLMD::cltools::Driver< real >
• Exception() : PLMD::Exception, PLMD::ExceptionDebug, PLMD::ExceptionError, PLMD::ExceptionTypeError, PLMD::lepton::Exception
• ExchangePatterns() : PLMD::ExchangePatterns
• exchangePatterns : PLMD::PlumedMain
• exchangePatterns_fwd : PLMD::PlumedMain
• exchangeStep : PLMD::PlumedMain
• excitation : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• excluded_region_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• exists() : PLMD::ActionWithValue, PLMD::Keywords
• exit() : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
• EXP : PLMD::lepton::Operation
• Exp() : PLMD::lepton::Operation::Exp
• exp : PLMD::bias::LWalls, PLMD::bias::UWalls, PLMD::manyrestraints::LWalls, PLMD::manyrestraints::UWalls
• exp_alpha_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• exp_b_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• exp_cs : PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift
• EXPAND : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >
• expandArgKeywordInPDB() : PLMD::ActionWithArguments
• ExpansionCVs() : PLMD::opes::ExpansionCVs
• expdists : PLMD::function::FuncPathGeneral
• expected_eps : PLMD::bias::MaxEnt
• explore() : PLMD::adjmat::DFSClustering, PLMD::adjmat::OutputCluster, PLMD::opes::convergence, PLMD::opes::exploration
• explore_dfs() : PLMD::adjmat::OutputCluster
• expo_ : PLMD::isdb::Rescale
• exponential : PLMD::SwitchingFunction
• ExponentiallyModifiedGaussianDiagonal() : PLMD::ves::TD_ExponentiallyModifiedGaussian
• ExponentialPowerDiagonal() : PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal
• expression : PLMD::function::Custom, PLMD::SwitchingFunction, PLMD::ves::TD_Custom
• expression_deriv : PLMD::function::Custom, PLMD::SwitchingFunction
• ExpressionProgram() : PLMD::lepton::ExpressionProgram
• ExpressionTreeNode() : PLMD::lepton::ExpressionTreeNode
• ExtendedLagrangian() : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
• extension() : PLMD::Tools
• External() : PLMD::bias::External
• extProduct : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• extra_biases_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• extra_msg() : PLMD::TypesafePtr
• extractArgumentDisplacement() : PLMD::Direction, PLMD::ReferenceArguments
• extractAtomicDisplacement() : PLMD::Direction, PLMD::MultiDomainRMSD, PLMD::OptimalRMSD, PLMD::ReferenceAtoms, PLMD::SimpleRMSD
• extractDisplacementVector() : PLMD::ReferenceConfiguration
• ExtraCV() : PLMD::colvar::ExtraCV
• extraCV : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::MDAtomsTyped< T >
• extraCVForce : PLMD::MDAtomsTyped< T >
• extraCVNeeded : PLMD::MDAtomsTyped< T >